Как и сейчас, компенсация из бюджета. Тем более СГЭТ - предприятие муниципальное.
Повышенная мобильность населения - повышенная посещаемость магазинов и т.п. по маршруту транспорта. Опять же, транспорт всё равно ездит, но за счет меньшей стоимости в нем будет ездить больше людей - повысится пассажиропоток, будет больше выручка. Например, за 50р. не всякий человек от Вавилова до Сенного поедет, а за 10р. почти любой поедет даже от Вавилова до Московской.
Или семье из 4-х человек съездить в центр погулять - при стоимости проезда 50р. им эта поездка в оба конца в 400р. обойдется, поэтому они у себя на Дачных по скверу погуляют и домой пойдут; а при стоимости проезда 10р. поездка обойдется в 80р., поэтому куда больше вероятность, что они несколько вечеров в неделю съездят погулять, а там уже и в кафе зайти могут...
В общем, мыслить надо шире в вопросе работы городского транспорта.